เรื่องราวของสองพี่น้องอย่าง “Edward” และ “Alphonse” พวกเขาเป็นนักเล่นแร่แปรธาตุ ที่พ่อแม่ของเขานั้นได้เสียชีวิตไปตั้งแต่เด็ก จากนั้น “Edward” และ “Alphonse” จึงได้ตัดสินใจเรียนรู้วิชาแปรธาตุอย่างจิงจัง เพื่อหวังว่าพวกเขาจะสามารถชุบชีวิตของพ่อและแม่ขึ้นมาอีกครั้ง แต่ทว่าอย่างไรก็ตามสถานการณ์เริ่มไม่ดี และไม่เหมือนที่พวกเขาคิดไว้เลย นอกจากพวกเขาจะไม่สามารถชุบชีวิตของแม่ได้แล้ว พวกเขายังต้องสูญเสียแขนและขาไปอีกด้วย “Alphonse”ได้สูญเสียร่างกายเกือบทั้งหมดของตนเพื่อทำตามกฎ “Edward” จำเป็นที่จะต้องงผนึกวิญญาณของ “Alphonse” เข้าไปไว้ในชุดเกราะของเขาเพื่อที่จะออกเดินทาง หาวิธีที่จะช่วยชีวิตน้องชายกลับมาอีกครั้งให้ได้